Program Studi Magister Ilmu Biomedik mempunyai visi menjadi program studi magister yang unggul dan bereputasi internasional dalam bidang ilmu biomedis. Program Studi Magister Ilmu Biomedik sedang dipersiapkan menjadi program S-2 berstandar internasional sesuai dengan standar yang disusun oleh World Federation for Medical Education.
Departemen Pendidikan Kedokteran dan Bioetika Fakultas Kedokteran, Kesehatan Masyarakat dan Keperawatan Universitas Gadjah Mada menyelenggarakan Program Studi S2 Ilmu Pendidikan Kedokteran dalam rangka peningkatan profesionalisme tenaga pendidik profesi dokter dan profesi kesehatan lainnya, sehingga mutu pendidikan kedokteran dan kesehatan dapat ditingkatkan.
Program Studi S2 Ilmu Kedokteran Tropis (IKT) Universitas Gadjah Mada (UGM) didirikan berkaitan dengan banyaknya penyakit tropis di Indonesia yang perlu ditangani secara profesional dan berkualitas. Pada saat itu di Indonesia belum ada pusat studi yang menyelenggarakan Program Studi S2 Ilmu Kedokteran Tropis.
Perkembangan pola pelayanan kedokteran dan kesehatan di Indonesia dalam menghadapi persaingan bebas membutuhkan tenaga medis yang lebih sempurna. Kecuali dituntut kualitas proses pelayanan kedokteran dan kesehatan yang optimal, juga dituntut kualitas pengembangan tugas pelayanan.
Program Studi Magister Imu Kesehatan Masyarakat, FK-KMK UGM menghasilkan peneliti, pembuat kebijakan dan praktisi kesehatan masyarakat yang unggul, inovatif, peduli, dan mengabdi pada kepentingan bangsa dan kemanusiaan yang dijiwai nilai-nilai budaya bangsa berdasar Pancasila.
Progam Studi Magister Kebijakan dan Manajemen Kesehatan, FK-KMK UGM memiliki rumusan kompetensi lulusan yang dibagi menjadi kompetensi utama, tambahan dan kompetensi lain. Kompetensi utama dicapai melalui mata kuliah dasar umum (MKDU) yang diikuti oleh seluruh peminatan, sedangkan kompetensi khusus diberikan sesuai dengan spesifikasi peminatan. Lulusan Program Magister KMK, FK-KMK UGM memiliki 70% kompetensi yang sama, kompetensi 70% muatan kurikulumnya seragam dengan muatan program studi. Hanya 30% yang berasal dari 30% kompetensi minat.
Program Studi Magister Keperawatan, FK-KMK UGM berdiri sejak tahun 2011 di bawah naungan. Saat ini Program Studi Magister Keperawatan FK-KMK UGM telah terakreditasi A oleh LAM-PT Kes pada tahun 2019 dan telah memperoleh sertifikasi AUN-QA di tahun 2021. Program Studi Magister Keperawatan FK-KMK UGM menawarkan 14 mata kuliah bebas dan 5 peminatan diantaranya Peminatan Keperawatan Anak, Keperawatan Maternitas, Keperawatan Medikal Bedah, Keperawatan Gawat Darurat, dan Keperawatan Jiwa.
Upaya pengembangan pendidikan Magister Kebidanan di prioritaskan untuk mengatasi kekurangan lulusan Magister Kebidanan (M.Keb) di Indonesia. Program ini diharapkan dapat memenuhi kebutuhan kuantitatif maupun kualitatif pelayanan kesehatan ibu dan anak yang merata dan berkeadilan. Pembentukan Prodi Magister Kebidanan merupakan salah satu upaya untuk menyiapkan sumber daya pendidik yang berkualitas dalam rangka peningkatan Kesehatan Ibu dan Anak (KIA).
