FK-KMK UGM. Program Studi Magister Ilmu Biomedik menyelenggarakan Workshop Biomedical UniqueVerse bertajuk BioXplore, Eksplorasi Data pada Penelitian untuk memperkenalkan pemanfaatan pangkalan data publik dan teknologi bioinformatika dalam penelitian biomedis. Kegiatan yang berlangsung pada 28 September 2026 ini menghadirkan dosen Departemen Histologi dan Biologi Sel FK-KMK UGM, dr. Satrio Adi Wicaksono, sebagai pemateri mengenai eksplorasi daring data RNA-Sequencing publik.
Dalam pemaparannya, dr. Satrio membahas cara memanfaatkan data RNA-Sequencing yang tersedia secara terbuka untuk mendukung penelitian biomedis. Data tersebut dapat menjadi sumber informasi tambahan bagi peneliti untuk mengeksplorasi pola ekspresi gen, mengembangkan pertanyaan penelitian, serta memperoleh petunjuk awal mengenai mekanisme biologis yang sedang dikaji.
Peserta diperkenalkan pada platform GEO2R untuk mengeksplorasi data ekspresi gen dan mengidentifikasi gen yang menunjukkan perbedaan ekspresi secara signifikan antarkelompok sampel. Melalui pendekatan ini, data yang telah dipublikasikan dapat ditelaah kembali untuk menemukan kemungkinan pola atau temuan yang belum banyak dibahas dalam publikasi awal. Hasil eksplorasi tersebut dapat menjadi dasar bagi penelitian lanjutan, meskipun tetap memerlukan penilaian kritis dan validasi sesuai kebutuhan penelitian.
Workshop ini juga memberikan kesempatan kepada peserta untuk mempelajari cara menelusuri ekspresi gen yang menjadi perhatian masing-masing. Selain itu, peserta dikenalkan pada pemanfaatan platform ARCHS dan STRING untuk membantu menelusuri fungsi gen serta hubungan antarmolekul yang relevan dengan pertanyaan penelitian. Pengenalan berbagai perangkat tersebut diharapkan dapat memperluas pemahaman peserta mengenai penggunaan sumber data terbuka dalam mendukung analisis biomedis.
Peserta kegiatan tidak hanya berasal dari mahasiswa Program Studi Magister Ilmu Biomedik FK-KMK UGM, tetapi juga mahasiswa dari luar program studi serta dosen dari institusi lain. Keberagaman peserta membuka ruang pertukaran pengetahuan dan pengalaman mengenai pemanfaatan teknologi dalam penelitian. Melalui diskusi dan praktik eksplorasi data, peserta dapat mengenali peluang penggunaan data publik sebagai salah satu sumber informasi untuk menyusun dan mengembangkan penelitian.
Sebelum sesi yang disampaikan dr. Satrio, workshop diawali dengan paparan mengenai eksplorasi data penelitian in vivo oleh dr. Nur Arfian, Ph.D., dari Departemen Anatomi. Materi berikutnya disampaikan oleh dr. Yogik Onky S.W., Ph.D., dari Departemen Biokimia yang membahas penggunaan Ensembl sebagai peramban genomik. Rangkaian materi ini memberikan gambaran mengenai beragam pendekatan untuk mengakses dan memanfaatkan sumber data biologis dalam penelitian biomedis.
Pengenalan berbagai platform tersebut menjadi bagian dari upaya mendekatkan perkembangan teknologi penelitian kepada dosen dan mahasiswa. Kemampuan menelusuri data genomik dan transkriptomik semakin relevan dalam penelitian biomedis karena memungkinkan peneliti memanfaatkan data yang telah tersedia untuk merumuskan hipotesis, mengidentifikasi kandidat gen, serta menentukan arah kajian berikutnya. Pemanfaatannya tetap perlu disertai pemahaman terhadap kualitas data, metode analisis, dan keterbatasan hasil yang diperoleh.
Kegiatan ini selaras dengan SDG 4 Pendidikan Berkualitas melalui pengembangan pengetahuan dan keterampilan penelitian. Kegiatan ini mendukung SDG 9 Industri, Inovasi, dan Infrastruktur melalui pengenalan teknologi dan metode analisis data biomedis. Kegiatan ini juga sesuai dengan SDG 17 Kemitraan untuk Mencapai Tujuan melalui pertukaran pengetahuan dan penguatan jejaring akademik lintas institusi. (Kontributor: Satrio Adi Wicaksono).
