FK-KMK konsisten dengan nilai-nilai universitas yaitu berasal dari rakyat dan untuk rakyat, dengan perwujudan pembelajaran berbasis komunitas yaitu Comprehensive Community Health Care-Education Program (CCHC-EP) sekitar tahun 1990. Disamping itu, pengalaman pembelajaran berbasis komunitas di FK-KMK juga tercermin dalam Kuliah Kerja Nyata (KKN) dan Kuliah Kerja Kesehatan Masyarakat (K3M).
Program elektif ini bertujuan untuk mengorganisir penempatan mahasiswa dari universitas luar negeri yang tertarik untuk meningkatkan pengetahuan mereka tentang penyakit yang umum di Indonesia, mendapatkan pengalaman baru dalam observasi klinis dan atau komunitas masyarakat di Indonesia, serta memperoleh praktik terbaik dari sistem kesehatan Indonesia, termasuk budaya Indonesia dan aspek sosialnya.
Program pertukaran mahasiswa, outgoing elektif, menawarkan kesempatan seluas-luasnya kepada seluruh mahasiswa Fakultas Kedokteran, Kesehatan Masyarakat, dan Keperawatan Universitas Gadjah Mada dalam mengikuti program pertukaran mahasiswa ke luar negeri di universitas mitra maupun universitas non mitra.
Summer/Winter Course bertujuan untuk meningkatkan interprofesional mahasiswa dengan masalah-masalah khusus yang menyertainya melalui pendekatan interdisipliner dan multi-universitas.